Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps5P59438 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms