Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm2P58774 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms