Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P58686 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P58686 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P58686 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P58686 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P58686 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms