Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Paxbp1P58501 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Paxbp1P58501 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms