Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dpf3P58269 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dpf3P58269 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms