Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpdl3bP58242 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms