Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp5P56399 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms