Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pex2P55098 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms