Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtskP55097 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtskP55097 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtskP55097 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtskP55097 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms