Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptpn5P54830 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms