Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacnb3P54285 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacnb3P54285 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms