Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PctpP53808 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PctpP53808 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PctpP53808 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PctpP53808 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PctpP53808 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms