Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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