Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox5P52651 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox5P52651 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms