Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp1P52624 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms