Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ClgnP52194 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms