Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec1P51908 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec1P51908 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms