Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc13P50207 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc13P50207 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms