Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Srp9P49962 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms