Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sstr4P49660 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sstr4P49660 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sstr4P49660 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sstr4P49660 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sstr4P49660 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr4P49660 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms