Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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PtpreP49446 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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