Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd1P48410 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms