Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gbx2P48031 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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