Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PfkmP47857 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PfkmP47857 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms