Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pax9P47242 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms