Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax7P47239 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax7P47239 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax7P47239 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms