Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cdkn1bP46414 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms