Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx2P43241 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx2P43241 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx2P43241 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx2P43241 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms