Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtgfrP43117 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms