Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdf5P43027 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms