Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pik3caP42337 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pik3caP42337 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms