Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CskP41241 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CskP41241 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CskP41241 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CskP41241 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms