Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LtbP41155 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LtbP41155 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LtbP41155 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LtbP41155 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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