Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms