Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csf3rP40223 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms