Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd1P40201 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd1P40201 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms