Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig1P37913 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig1P37913 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig1P37913 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms