Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprkP35822 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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