Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TpoP35419 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TpoP35419 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TpoP35419 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TpoP35419 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms