Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpardP35396 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpardP35396 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PpardP35396 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PpardP35396 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpardP35396 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpardP35396 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpardP35396 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms