Protein–RNA interactions for Protein: P35385

Hspb7, Heat shock protein beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb7P35385 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hspb7P35385 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms