Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab23P35288 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms