Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab5cP35278 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab5cP35278 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab5cP35278 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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