Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mmp12P34960 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms