Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms