Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp2P29594 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp2P29594 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms