Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms