Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprmP28828 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprmP28828 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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