Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa5P28312 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms