Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms